Андрей Филаретов — племянник братьев Столетовых, сын их сестры Варвары Григорьевны и владимирского губернского архитектора Андрея Павловича Филаретова. Андрей Филаретов — выпускник Владимирской губернской мужской гимназии и Военно-медицинской академии в Санкт-Петербурге. Еще в студенческие годы он принял участие в мероприятиях по борьбе с эпидемией холеры.
По окончании академии Филаретов служил младшим врачом в крепости Брест, врачом Кронштадтского госпиталя и судов военно-морского флота, принимал участие в длительных морских походах. В 1898 году он защитил докторскую диссертацию. В 1900 году Андрей Андреевич завершил службу на флоте и перешел в медицинский департамент Министерства внутренних дел. Он неоднократно участвовал в мероприятиях по борьбе с холерой и чумой в разных регионах страны. Впоследствии Филаретов дослужился до чина действительного статского советника, за службу был награжден орденами Святого Станислава II и III степени и Святой Анны II степени.
Личная жизнь Андрея Андреевича сложилась не слишком удачно. Его невеста Ольга Тарасова внезапно скончалась незадолго до свадьбы. Поддержку и сочувствие он находил у своего знакомого — подполковника Рафаила Зотова. А когда друга не стало, то Андрей Андреевич счел своим долгом помочь его семье: он женился на вдове Пелагее Зотовой и усыновил ее детей Михаила и Елизавету. Дети подросли, Елизавета вышла замуж. Однако в 1919 году Пелагея Ивановна умерла, и Андрей Андреевич остался вдвоем с пасынком Мишей.
Через два года он женился на Елизавете Гефтлер — дочери художника и архитектора Карла Гефтлера. В 1923 году у них появился первенец — Андрей. Родственники, бывавшие в семье Филаретовых, отмечали, что Андрей Андреевич был прекрасным семьянином, заботливым, чутким, отзывчивым мужем.
После революции 1917 года он служил в системе
здравоохранения врачом-эпидемиологом и государственным санитарным инспектором.
В 1933 году его арестовали по обвинению в «контрреволюционной деятельности и
обработке в фашистском духе молодежи» и выслали в Новосибирск сроком на пять
лет. Елизавета Карловна уехала вслед за мужем. В 1938 году семья Филаретовых
поселилась в Красногвардейске (ныне — Гатчина), где в 1941 году встретила
Великую Отечественную войну. За несколько дней до прихода немецких войск они
ушли в Ленинград. Не выдержав тяжелых блокадных условий, Андрей Андреевич
Филаретов 10 февраля 1942 года скончался от истощения.