С началом Великой Отечественной войны экономика советского государства перестраивалась на военные рельсы. В связи с экономией ресурсов (алюминий был необходим в самолетостроении), на замену алюминиевым фляжкам начали производить стеклянные фляги, аналогичные существовавшим в Российской Императорской армии.
Стеклянные фляги выпускались из различного по цвету стекла (цвет зависел от состава применяемого сырья). Горлышко затыкалось, как правило, резиновой пробкой. Имела ёмкость 0,75 и 1 литр, переносилась в чехлах. Отличалась от алюминиевых фляг большим собственным весом — например, стеклянная фляга ёмкостью 0,75 литра весила 450 граммов (алюминиевая, ёмкостью 0,75 литра — 183 грамма). Производство алюминиевых фляг было возобновлено лишь в 1948 году.