В 1812 году генерал Бонами участвовал в российском походе Наполеона. В Бородинском сражении генерал Бонами возглавил атаку 30-го линейного полка 1-й пехотной дивизии Морана на батарею Раевского в центре позиции. Вопреки диспозиции Наполеона, он повёл полк не в батальонных колоннах, а в развёрнутом строю. Взял штурмом батарею Раевского, но затем был разбит русской контратакой. Генерал, получивший 13 штыковых ран, был взят в плен фельдфебелем 1-й гренадерской роты 18-го егерского полка Василием Золотовым. Желая спастись, Бонами назвал себя королем неаполитанским Мюратом, крича на ломаном русском языке, что он «король Мюрат». Плененного француза гренадер Золотов отвел к М.И. Кутузову, за что был произведен в офицеры и получил чин подпоручика.
Генерал А. П. Ермолов, руководивший контратакой на батарею Раевского, принял личное участие в судьбе Бонами, отправив того на лечение в дом своего отца в городе Орёл. В плену Бонами находился до самого окончания Шестой коалиционной войны, которая положила конец правлению Наполеона. После он был отпущен на родину.